樣本間交叉污染
主要是在采（取）樣的過程中，由于取樣工具之間的交叉造成污染；或者在核酸提取的過程中，由于移液器、離心管等使用不當導致的污染。
PCR試劑的污染
主要是在PCR試劑配制過程中，由于移液器、容器、陰性對照及其它試劑被核酸模板或陽性對照污染。
質粒的污染
在實驗室操作中經常會用到陽性參考品，這些陽性參考品大多數是由某些質粒制作而成，質粒在單位容積內濃度高，不小心使用極易造成污染。
PCR擴增產物污染
這是PCR反應中常見的污染問題。因為PCR產物拷貝量大，遠遠高于PCR檢測數個拷貝的極限，所以極微量的PCR產物污染，就可造成假陽性結果。還有一種容易忽視，可能造成PCR產物污染的形式是氣溶膠污染，在空氣與液體面摩擦時就可形成氣溶膠，據計算一個氣溶膠顆粒可含4.8萬拷貝，因而由其造成的污染是一個值得特別重視的問題。
這些常見物品的外表面容易被核酸和細菌污染，主要查看這兩個指標。
（1）表面核酸污染：用沾濕的拭子擦拭上述物品的外表面，然后浸泡到純水中10min，吸取純水作為模板進行擴增，qPCR無擴增為合格。
（2）移液器內腔核酸污染：對于常用的移液器的內部，可使用無濾芯的吸頭在陰性純水中吹吸10次后，吸取純水作為模板進行擴增，qPCR無擴增為合格。
（3）表明細菌污染：用沾濕的無菌拭子擦拭上述物品的外表面，劃瓊脂平板，每個平板的菌落數不應超過一定數量（我也不確定多少合適，由于不要求無菌操作一定會有細菌，但是也不應該太多）。
非瘟和新冠后一下子新增了很多核酸檢測實驗室，早期大家關注的點都在設施和硬件上，但是一個檢測實驗室開展大量檢測工作之后，檢測中弱的環節決定檢測的質量。我們也需要將精力放在檢測中的每個細節上。
根據實驗室的具體情況編寫質量體系文件，《質量手冊》、《程序文件》、《作業指導書》，并保證管理體系運行有效。
管理體系的特點是應有明確的目的、規范的管理、有效的制約、的機制、能自我發展的整體。
建立完善的SOP文件，對完成各項質量活動的方法作出規定，每個SOP都應對一個或一組相互關系的活動進行描述。
每個SOP文件應說明該項質量各環節的輸入、轉換和輸出所需的文件、物資、人員、記錄以及它們與有關活動的接口關系。
明確每個環節轉換過程中各項因素的要求，即由誰做、做什么、做到什么程序、達到什么要求，如何控制、形成什么記錄和報告，以及相應的審批手續。
規定在質量活動中需要注意的例外或特殊情況的糾正措施。SOP應簡練、明確和易懂并且工作人員熟練掌握和嚴格遵守。
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